Приведем пример, как это можно сделать для стандартного шаблона moguta (папка mg-templates -> папка moguta -> файл template.php). Например, после закрывающего тега можно вставить скопированный из личного кабинета фрагмент кода:
Данные методы оплаты должны быть активны в вашем личном кабинете. Для удаления какого-либо варианта оплаты вы можете убрать соответствующую кнопку из верстки.